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土地增值稅預繳計稅依據是根據《土地稅法》及其實施條例、土地增值稅暫行條例（修訂）、《企業所得稅法》等有關政策規定所制定的，由院財政部門和地方政府共同規定的。總的來說，首先要確定增值稅納稅義務人，然後依據《企業所得稅法》第三十五條款和第二款之規定等確定納稅義務人的收益，利用收益確定減免範圍，根據《土地增值稅暫行條例（修訂）》的有關規定，確定土地增值稅稅率，確定稅款的計算，確定土地增值稅納稅義務人的預繳稅款。拓展知識：土地增值稅是由財政部、地方政府共同根據《中華人民共和國土地稅法》及其實施條例、《土地增值稅暫行條例（修訂）》等法律、行政法規規定的，以土地取得或使用的費用和收入計算納稅人應繳納的稅款。相比於一般的增值稅，土地增值稅的特殊之處在於它比較重視企業土地交易的價格，企業受益，要按照收益額的比例計稅，所以又叫做增值稅，也可以稱爲“收入稅”。